开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)
一、课题研究背景和拟解决的问题
本课题组前期在对肝素酶Ⅲ结构信息分析的基础上,将其活性中心位点附近氨基酸突变为半胱氨酸后,通过对硫酸软骨素、透明质酸、海藻酸钠等多糖进行底物特异性研究筛选突变体,筛选得到了既能水解硫酸乙酰肝素(alpha;-1,4)又随机具有裂解透明质酸(beta;-1,4)能力的双功能酶突变体K102C。本课题将在此基础上,鉴定K102C水解新底物透明质酸的产物,初步分析该酶底物选择性与酶结构的关系,从而揭示肝素酶的分子进化机制。
二、采用的研究手段
1. 透明质酸裂解产物鉴定
反应混合物(400ml 1mg/ml透明质酸溶液,575ml 50mM Tris-HCl,25ml酶溶液)在37℃反应过夜,煮沸10分钟终止反应,12000 r/min离心去除酶,10 kDa浓缩产物溶液并冻干。紫外光谱扫描、红外光谱(IR)、DNS法和液质联用法确定K102C催化透明质酸降解产物。
1.1紫外光谱扫描
紫外可见分光光度计在190nm到300nm范围内检测不饱和低聚物,肝素水解产物做对照。
1.2傅里叶变换红外光谱学方法
取100 – 200mg溴化钾(KBr)粉末与产物混合5-15min,傅里叶变换红外(ir)光谱仪测量,标准肝素、透明质酸作为对照。傅立叶变换红外光谱检测范围为400- 4000cm-1。
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