遗传性神经肌肉病相关基因突变数据库的构建文献综述

 2023-12-08 10:43:54

文献综述

遗传性神经肌肉病(hereditary neuromuscular disease)是以运动功能障碍为主要临床特征的一组遗传性疾病,主要包括遗传性肌病、周围神经病、运动神经病和神经肌肉接头病等,每类疾病根据临床特点、遗传方式以及基因突变位点的不同又分为若干个亚类。各种亚型之间临床表现存在很大重叠,通过肌肉活检、免疫组化、免疫荧光染色等检查可以帮助确定部分亚型,但仍有一大部分无法确定具体类型。在早期基因组时代,Sanger测序经常被用基因诊断的一种方法,但是确定一个基因是否发生了有害突变往往需要花费了大量的时间和精力。为了进一步评估拷贝数变异和结构变异,需要采用多重连接依赖性探针扩增(MLPA)和比较基因组杂交(CGH)技术作为综合诊断策略。目前,有200多种基因被报道是遗传性神经肌肉病症的原因,这种情况并不适用于通过Sanger测序筛选每个基因进行遗传诊断,而二代测序技术则更加适合。二代测序能够快速,经济有效地筛选整个基因组,整个外显子或选定的靶基因和特定的基因组区域。近年来,目标NGS Panel已被用于诊断神经肌肉疾病患者。与全外显子组测序(WES)和全基因组测序(WGS)相比,靶向基因测序具有较低成本,较高的测序深度和覆盖范围,是一种有效的遗传病辅助诊断技术。但是由于二代测序数据量巨大,即使是靶向基因测序,每个样本也可以检测出几千至几万个变异点,如何从这些变异点中筛选出真正的致病点成为了二代测序技术的难点。目前主要通过频率数据库如1000Genome,ESP6500数据库以及致病性评价数据库如HGMD,ClinVAR等对原始变异位点进行过滤以筛得候选位点。因此变异位点的频率和遗传变异-临床表型相关数据库对于疾病的诊断具有重要意义。而神经遗传病的基础研究,在我国处于尚未广泛开发的处女地,中国人口众多,具有大量的神经遗传病患者,但国内对遗传性神经肌肉病的系统研究相对匮乏,构建中国遗传性神经肌肉病基因突变数据库有很大的意义。

参考文献:

[1] Morgan S, Shoai M, Fratta P, Sidle K, Orrell R, Sweeney MG, Shatunov A, Sproviero W, Jones A, Al-Chalabi A, Malaspina A, Houlden H, Hardy J, Pittman A. Investigation of next-generation sequencing technologies as a diagnostic tool for amyotrophic lateral sclerosis. Neurobiol Aging. 2015; 36(3):1600.

[2] Shin HY, Jang H, Han JH, Park HJ, Lee JH, Kim SW, Kim SM, Park YE, Kim DS, Bang D, Lee MG, Lee JH, Choi YC. Targeted next-generation sequencing for the genetic diagnosis of dysferlinopathy. NeuromusculDisord. 2015; 25(6):502-10.

[3]Chae JH, Vasta V, Cho A, Lim BC, Zhang Q, Eun SH, Hahn SH. Utility of next generation sequencing in genetic diagnosis of early onset neuromuscular disorders. J Med Genet. 2015; 52(3):208-16.

剩余内容已隐藏,您需要先支付 10元 才能查看该篇文章全部内容!立即支付

以上是毕业论文文献综述,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。