课题:拟青霉属真菌菌株TIBETAN32苯酚降解酶类的表达分析本课题旨在初步揭示拟青霉属真菌菌株TIBETAN3降解苯酚分子机制。
主要方法和手段:一、可降解苯酚菌株TIBETAN32的鉴定(1) 基于ITS序列、D1D2区域、beta;-tubulin基因构建系统发育进化树采用全基因组提取试剂盒提取菌株TIBETAN32的总DNA。
以通用引物ITS1、ITS4对ITS序列进行扩增,以通用引物Bt2a,Bt2b对beta;-tubulin基因进行扩增,以通用引物NL1、NL4对D1D2区域进行扩增,反应体系(25mu;L):2Taq PCR Master Mix 12.5mu;L,上游引物 0.5mu;L,下游引物 0.5mu;L,DNA模板 1mu;L,双蒸水 10.5mu;L。
反应条件:预变性:95℃ 5min,变性 95℃ 30s,退火55℃ 30s,延伸72℃ 45s,30个循环数,后延伸72℃ 10min。
产物保藏于-20℃待用。
取2mu;L PCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳检测。
纯化后交至测序公司完成测序工作,将结果输至NCBI数据库中,应用Blast程序进行相似性比对,通过MEGA 7.0软件采用邻接法构建系统发育进化树。
(2) 在不同培养基下观察菌株的形态学将菌株TIBETAN32接种于CA、CYA、CYAS、MEA、DG18、CREA、YES固体培养基中,30℃下培养7d,观察菌株TIBETAN32在不同培养基下的菌落生长情况。
二、菌株TIBETAN32降解苯酚酶类的表达分析(1) 苯酚羟基化酶基因(PH)的扩增采用全基因组提取试剂盒提取菌株TIBETAN32的总DNA。
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