开题报告内容:
研究目的:
通过提取细胞内cDNA分段扩增目的片段,overlap-PCR,同源重组技术,质粒转化及鉴定等方法构建pcmv-GFP-Notch1质粒来作为未来的研究的基础。
文献综述:
质粒(plasmid)是细菌、酵母菌和放线菌等生物中染色体(或拟核)以外的DNA分子,存在于细胞质中,具有自主复制能力,使其在子代细胞中也能保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息,是闭合环状的双链DNA分子。质粒不是细菌生长繁殖所必需的物质,可自行丢失或人工处理而消除,如高温、紫外线等。质粒携带的遗传信息能赋予宿主菌某些生物学性状,有利于细菌在特定的环境条件下生存。质粒具有自主复制能力,使其在子代细胞中也能保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息。细菌质粒是DNA重组技术中常用的载体。载体是指把一个有用的外源基因通过基因工程手段,送进受体细胞中去进行增殖和表达的工具。将某种目标基因片段重组到质粒中,构成重组基因或重组体。然后将这种重组体经微生物学的转化技术,转入受体细胞(如大肠杆菌)中,使重组体中的目标基因在受体菌中得以繁殖或表达,从而改变寄主细胞原有的性状或产生新的物质。Notch基因编码一类高度保守的细胞表面受体,它们调节从海胆到人等多种生物细胞的发育。Notch信号影响细胞正常形态发生的多个过程,包括多能祖细胞的分化、细胞凋亡、细胞增殖及细胞边界的形成。Notch基因位点突变引起的表型改变,表明Notch信号作用的多样性。Notch 信号通路作为调控细胞增殖与分化的经典途径,
在众多癌症尤其是上皮细胞癌中起到重要的作用。Notch l 受体作为 Notch 信号通路的重要组成,在众多癌症中异常表达。在 Notch 信号通路中, Notch 受体通过与配体的相互作用转导细胞信号,进而在细胞增殖、分化、凋亡中发挥重要的调控作用。Notch 分子由胞外段、跨膜区和胞内段组成, 胞外段负责和配体的结合, 胞内段则含有多个功能结构域,是Notch 分子的主要功能区域。当胞外段受到配体刺激后,Notch 分子水解后在胞内释放 NIC 并进入核内与细胞因子RBP - J 相互作用,进而调节细胞的增殖、分化和凋亡 。哺乳动物有 4 种 Notch 受体: Notch1 - 4; 其中 Notch1与肿瘤,特别是上 皮 肿 瘤 的 的 关 系 最 为 密 切,因此我们选择将Notch1的NIC插入到表达载体中进行研究。
基本内容:
3.1基因克隆:
从 GenBank 中检索到 Notch1 的编码序列,根据其胞内段设计扩增引物 F1 ( 5 ' - CTGCTGTCCCGCAAGCGC - 3') 和 R1( 5'- CTTGAAGGCCTCCGGAATGCGG -3') 以及质粒构建引物 F2( 5'- CGGAATTCTGATGCTGCTGTCCCGC - 3',5'端增加 EcoR I 酶切位点) 和 R2( 5'- CGGGATC-CTTGAAGGCCTCCGG - 3 ', 3 '端 增 加 BamH I 酶 切 位 点) 。CNE1 细胞培养 3 代以后, 利用 RNeasy Mini Kit 提取 RNA,PrimeScript RT - PCR Kit 反转录为 cDNA; 以该 cDNA 为模板,F1 和 R1 为引物进行 PCR 扩增, 扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测。T载体为线状的DNA片段,3rsquo;端带有突出的“T”尾,同时Tap酶在PCR 产物的5rsquo;末端加上非模板依赖性A碱基。TA克隆技术利用T碱基与A碱基互补配对,快速准确的使PCR产物在连接酶的作用下与T载体粘性连接,重组为环状DNA分子,从而极大提高克隆效率。
3.2质粒构建 :
通过双点突变PCR扩增的方式分别获得1000kb和6000kb的片段,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定。凝胶DNA提取PCR产物1.5%琼脂糖凝胶电泳后,紫外灯下切取DNA片段,放于1.5 mL离心管中称量后,加入3倍体积Buffer QG。50 ℃水浴10 min,检查其颜色为黄色后加入 1 倍体积异丙醇混匀并移入 2 mL吸附柱内。17 900 r/min离心1 min,弃收集液。 加500 mu;L
Buffer QG于吸附柱内,17 900 r/min离心1 min,弃收集液。加750 mu;L Buffer PE于吸附柱内,17 900 r/min离心1 min,弃收集液。将吸附柱放入新的1.5 ml收集管内,加50 mu;L Buffer EB,放置1 min,17 900 r/min离心1 min,弃吸附柱。收集的液体即为提取的DNA
溶液。提取 DNA 溶液通过光密度分析仪测定其浓度及OD值。回收产物与经限制性内切酶 EcoR I 和 BamH I 修饰后纯化,经 T4 DNA Ligase 连接后转化大肠杆菌。
3.3重组质粒的鉴定:
挑取单克隆,过夜培养后提取质粒; 质粒经 PCR 和单双酶切鉴定; 对阳性质粒进一步进行DNA 测序鉴定。
预期结果:
成功构建pcmv-GFP-Notch1质粒。寻找疾病诊断和治疗的新靶向奠定基础。为未来的实验以及研究做好准备。
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